Datant du vie siècle et peu modifiée depuis, elle fait partie des plus belles églises primitives à plan basilical qui nous soit parvenue si bien conservée. Elle possède également un superbe ensemble de mosaïques byzantines du vie siècle. Commencée par l'évèque Ursicinus, l'église fut inaugurée le 9 mai 549 par l'évèque Maximien. Apollinaire rassembla la première communauté chrétienne de Ravenne et en fut le premier évèque. La basilique de Classis fut bâtie sur son tombeau. Les murs extérieurs de l'église, très simples, sont composés de briques rouges très plates. Elle présente un narthex, qui succède au quadriportique d'origine. Le campanile cylindrique du xe siècle comporte des ouvertures à  un, deux et trois arcs. L'intérieur est à trois nefs délimitées par deux rangées de 12 colonnes de marbre grec, surmontées de chapiteaux byzantins. Le plafond a perdu ses caissons d'origine, et les anciennes mosaïques de sol ont disparu. L'abside est accessible par les marches d'un large escalier. Sous l'autel se trouve la tombe de saint Apollinaire.